Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssr4Q62186 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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