Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd1Q62101 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prkd1Q62101 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prkd1Q62101 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prkd1Q62101 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prkd1Q62101 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prkd1Q62101 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Prkd1Q62101 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prkd1Q62101 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prkd1Q62101 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prkd1Q62101 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prkd1Q62101 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Prkd1Q62101 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prkd1Q62101 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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