Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ifi47Q61635 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Ifi47Q61635 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifi47Q61635 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ifi47Q61635 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms