Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1aQ61495 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1aQ61495 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms