Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1eQ61290 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1eQ61290 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1eQ61290 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cacna1eQ61290 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1eQ61290 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cacna1eQ61290 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cacna1eQ61290 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 246.9 ms