Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nab1Q61122 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nab1Q61122 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nab1Q61122 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nab1Q61122 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nab1Q61122 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nab1Q61122 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Nab1Q61122 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nab1Q61122 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Nab1Q61122 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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