Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gbp4Q61107 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms