Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd40Q5SUE8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms