Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Slc38a8Q5HZH7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms