Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Taf3Q5HZG4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Taf3Q5HZG4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms