Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem241Q3UME2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem241Q3UME2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms