Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trip13Q3UA06 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trip13Q3UA06 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms