Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LbrQ3U9G9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LbrQ3U9G9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms