Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pag1Q3U1F9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pag1Q3U1F9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pag1Q3U1F9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pag1Q3U1F9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pag1Q3U1F9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pag1Q3U1F9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pag1Q3U1F9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pag1Q3U1F9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms