Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc162pQ0VG85 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc162pQ0VG85 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms