Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Samd12Q0VE29 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms