Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Calb2Q08331 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calb2Q08331 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms