Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPINDOCQ05AH6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SPINDOCQ05AH6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms