Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sox13Q04891 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms