Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox8Q04886 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox8Q04886 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms