Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smarcad1Q04692 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms