Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mc1rQ01727 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mc1rQ01727 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms