Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Serpina1cQ00896 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms