Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cds1P98191 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cds1P98191 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cds1P98191 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cds1P98191 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cds1P98191 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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