Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nucb2P81117 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms