Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabpb2P81069 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabpb2P81069 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.9 ms