Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Acta1P68134 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Acta1P68134 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Acta1P68134 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Acta1P68134 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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