Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Vamp3P63024 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms