Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpm2P58774 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpm2P58774 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms