Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NcstnP57716 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms