Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bp1P55194 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bp1P55194 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms