Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad23aP54726 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms