Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lbx1P52955 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lbx1P52955 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lbx1P52955 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lbx1P52955 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lbx1P52955 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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