Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa8P50706 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa8P50706 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms