Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cxcl5P50228 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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