Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Syt1P46096 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syt1P46096 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syt1P46096 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms