Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh2P43247 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh2P43247 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms