Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mmp9P41245 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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