Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
VhlP40338 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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VhlP40338 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
VhlP40338 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
VhlP40338 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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