Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gja4P28235 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms