Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Trbv2-201ENSMUST00000103263 560 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd11P23813 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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