Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxd12P23812 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms