Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NelfeP19426 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NelfeP19426 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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NelfeP19426 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NelfeP19426 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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