Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18524 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18524 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18524 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18524 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms