Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Spi1P17433 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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