Protein–RNA interactions for Protein: P15209

Ntrk2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntrk2P15209 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ntrk2P15209 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms