Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxa9P09631 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms