Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxb7P09024 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxb7P09024 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms