Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxa4P06798 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms