Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HbaP01942 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HbaP01942 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HbaP01942 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HbaP01942 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HbaP01942 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms